간행물

생화학분자생물학회입니다.


국내 / 연구실 소개

Human Genetics and Genomics Laboratory

  • 작성자

    최정민(고려대학교)
  • 작성일자

    2020-12-07
  • 조회수

    1452

Human Genetics and Genomics Laboratory

 

최정민

고려대학교 의과대학 의과학과

 

 

연구실 소개

 BK21 플러스 사업단에 소속되어 있는 본 연구실은 인간 유전학 및 유전체학을 기반으로 지난 10년동안 도약적으로 발달한 차세대 염기서열 분석기술 (NGS) 을 활용하여 각종 유전 질환 및 암 질환의 발병기전을 분자적인 수준에서 탐색, 이해하고 한국 및 전세계 전문가 그룹과 공동연구를 통해서 개인맞춤형 정밀의학 구현을 위한 다양한 프로젝트들을 진행하고 있습니다.

 

연구내용

1. 복합 유전질환 유전체

 한국이 빠르게 고령화 사회에 진입하게 되면서 치매와 같은 복합 퇴행성 유전질환 환자의 수가 기하급수적으로 증가하고 있습니다. 본 연구실에서는 3,500여명의 치매 환자 WES데이터에서 도출한 희귀 유전변이와 GWAS 데이터에서 도출한 공통 유전변이의 상호작용 (Epistasis)을 다인유전 (Polygenic inheritance)에 기반하여 통계 모델을 구축하고 있습니다. 이를 통해서 치매의 원인 유전자 동정의 검정력을 극대화하고 복합 형질 (Complex trait)을 양적으로 설명하는 동시에 더 나아가 고위험 예측 점수 (Polygenic Risk Score) 방법론을 개발하여 치매 위험 요인을 조기에 발굴하여 개인맞춤 치료의 초석을 다지고 있습니다.

2. 미진단 / 초희귀질환 유전체

 희귀질환은 통상 유병인구가 2만명 이하이거나 진단이 어려워 유병인구를 알 수 없는 질환으로 우리나라에도 현재 1,000여종이 추정되고 매년 증가하는 추세에 있습니다. 특히 유병인구가 200명 이하인 초희귀질환과 미진단 희귀질환의 경우는 그간 진단의 어려움과 효과적인 치료의 부재로 의료의 사각지대로 치부되었습니다. 본 연구실에서는 이러한 초희귀질환 및 미진단 희귀질환 환자들의 ‘Unmet need’ 를 충족하기 위해 WGS 데이터로 도출한 유전변이를 활용하여 효과적이고 검정력이 높은 발병 유전자 규명 방법론 구축 및 기능성 평가를 통한 분자수준의 질환 기전 이해를 위한 연구를 진행하고 있습니다.

3. 단일세포전사체 기반의 암 유전체

 항암면역치료는 화학요법이나 방사선요법이 가진 내재적인 한계를 극복할 수 있는 획기적인 대안으로 급부상하면서 암 치료에 새로운 패러다임을 제공했습니다. 특히 국내 암 사망률 1위인 폐암 환자의 약 40%에서 지속적인 임상 효과를 보여주며 각광을 받고 있습니다만 약 1억원에 달하는 치료비용 문제가 큰 사회경제적인 부담으로 작용하고 있기도 합니다. 본 연구실에서는 항암면역치료에 지속적인 임상 효과가 있는 폐암/유방암 환자군과 효과가 없는 환자군의 단일세포 전사체 기반의 유전체 데이터 (single-cell RNA-Seq)의 비교 분석을 통해서 항암면역치료의 임상적인 혜택을 결정짓는 유전적인 인자를 규명하고 예측 가능한 바이오마커를 발굴하는 연구를 진행 중입니다. 이와 같은 연구를 바탕으로 불필요한 의료 지출을 방지하고 암 환자의 유전적 특성에 따른 치료법을 제공하는 개인맞춤형 정밀의료 실현에 기여하고자 합니다.  

연구책임자

 


최정민

주소: 서울특별시 성북구 고려대로 73, 제1의학관 3130호

고려대학교 의과대학 의과학과

전화: +82-2-2286-1469

Email: jungminchoi@korea.ac.kr

Homepage: https://choi.korea.ac.kr

 

연구진구성

교수:                      최정민

연구교수:                이종원

석박사과정 대학원생: 이정수, 김예린

연구원:                   이재원, 정경조

학부생:                   천하림, 김수림, 조아현, 김지현​

  

(좌)이재원, 천하림, 이종원, 정경조, 최정민 (우)

 

대표 논문

1. Duran D*, Zeng X*, Jin SC*, Choi J*, Nelson-Williams C, Yatsula B, Gaillard J, Furey CG, Timberlake AT, Mansuri MS, Sorscher MA, Loring E, Klein J, Lu Q, JD Montejo, Vera A, Hu JK, Allocco A, Karimy JK, Panchagnula S, Youngblood MW, Zhang J, DiLuna ML, Matouk CC, Mane S, Tikhonova I, Castaldi C, López-Giráldez F, Knight J, Haider S, Alper SL, Komiyama M, Ducruet SF, Zabramski JM, Dardik A, Aagaard-Kienitz B, Rodesch G, Jackson E, Smith ER, Orbach DB, Berenstein A, Vikkula M, Bilguvar K, Gunel M, Lifton RP, Kahle KT. Mutations in Chromatin Modifier and Ephrin Signaling Genes in Vein of Galen Malformation. Neuron. 2019 Feb 6;101(3):429-443.e4. doi: 10.1016/j.neuron.2018.11.041. Epub 2018 Dec 18. PubMed PMID: 30578106. (*co-first authors)

2. Sierant MC, Choi J*. Single-Cell Sequencing in Cancer: Recent Applications to Immunogenomics and Multi-omics Tools. Genomics Inform. 2018 Dec;16(4):e17. doi:10.5808/GI.2018.16.4.e17. Epub 2018 Dec 28. PubMed PMID: 30602078. (*corresponding author)

3. Gettinger SN*, Choi J*, Mani N*, Sanmamed MF, Datar I, Sowell R, Du VY, Kaftan E, Goldberg S, Dong W, Zelterman D, Politi K, Kavathas P, Kaech S, Yu X, Zhao H, Schlessinger J, Lifton R, Rimm DL, Chen L, Herbst RS, Schalper KA. A dormant TIL phenotype defines non-small cell lung carcinomas sensitive to immune checkpoint blockers. Nat Commun. 2018 Aug 10;9(1):3196. doi: 10.1038/s41467-018-05032-8. PubMed PMID: 30097571; PubMed Central PMCID: PMC6086912. (*co-first authors)

4. Furey CG*, Choi J*, Jin SC, Zeng X, Timberlake AT, Nelson-Williams C, Mansuri MS, Lu Q, Duran D, Panchagnula S, Allocco A, Karimy JK, Khanna A, Gaillard JR, DeSpenza T, Antwi P, Loring E, Butler WE, Smith ER, Warf BC, Strahle JM, Limbrick DD, Storm PB, Heuer G, Jackson EM, Iskandar BJ, Johnston JM, Tikhonova I, Castaldi C, López-Giráldez F, Bjornson RD, Knight JR, Bilguvar K, Mane S, Alper SL, Haider S, Guclu B, Bayri Y, Sahin Y, Apuzzo MLJ, Duncan CC, DiLuna ML, Günel M, Lifton RP, Kahle KT. De Novo Mutation in Genes Regulating Neural Stem Cell Fate in Human Congenital Hydrocephalus. Neuron. 2018 Jul 25;99(2):302-314.e4. doi: 10.1016/j.neuron.2018.06.019. Epub 2018 Jul 5. PubMed PMID: 29983323. (*co-first authors)

5. Gettinger S*, Choi J*, Hastings K*, Truini A*, Datar I*, Sowell R, Wurtz A, Dong W, Cai G, Melnick MA, Du VY, Schlessinger J, Goldberg SB, Chiang A, Sanmamed MF, Melero I, Agorreta J, Montuenga LM, Lifton R, Ferrone S, Kavathas P, Rimm DL, Kaech SM, Schalper K, Herbst RS, Politi K. Impaired HLA Class I Antigen Processing and Presentation as a Mechanism of Acquired Resistance to Immune Checkpoint Inhibitors in Lung Cancer. Cancer Discov. 2017 Dec;7(12):1420-1435. doi: 10.1158/2159-8290.CD-17-0593. Epub 2017 Oct 12. PubMed PMID: 29025772; PubMed Central PMCID: PMC5718941. (*co-first authors)


첨부파일