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긴 비암호화 RNA (long-noncoding RNA)의 최신 연구동향

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    관리자
  • 작성일자

    2020-11-18
  • 조회수

    1333

긴 비암호화 RNA (long-noncoding RNA)의 최신 연구동향

장 수 환
울산대학교 의과대학 의생명과학교실
Tel : 02-3010-2095
Email : Suhwan.chang@amc.seoul.kr

서론

긴 비암호화 RNA (long-noncoding RNA; lncRNA)는 일반적으로 200 nucleotide 이상이면서 단백질을 만들지 않는 RNA의 그룹을 나타낸다(1). 차세대 염기서열 분석으로 많은 비암호화 RNA가 발견되었지만 초기에는 단백질을 만들지 않는 특성으로 인하여 기능이 별로 없는 부산물 정도로 여겨졌다. 하지만 이후 몇 가지 중요한 발견들에 의하여 사실은 이 긴 비암호화 RNA가 다양한 생물학적 기능을 가진 것으로 밝혀지고 있다. 예를 들면 X 염색체 불활성화에 작용하는 XIST(2), 위치식별에 중요한 HOTAIR (Hox Transcript Antisense RNA)(3), telomerase의 기능에 필수적인 TERC (Telomerase RNA Component)(4) 등이 모두 긴 비암호화 RNA에 속한다. 이러한 기능과 연관되어 암, 치매 등 인류가 고통받고 있는 다양한 질병들에서 비정상적인 긴 비암호화 RNA의 발현 및 돌연변이들이 중요한 원인으로 이해되고 있다(5). 본 리뷰에서는 암을 중심으로 하여 긴 비암호화 RNA의 최신 연구동향과 함께 향후 응용방안에 대한 다양한 가능성을 정리해 보고자 한다.

본론

1. 긴 비암호화 RNA의 다양한 기능들

많은 긴 비암호화 RNA는 아직까지 그 기능이 특정되지 않았으며 상당부분은 아마도 특별한 기능이 없을지도 모른다. 그럼에도 불구하고 긴 비암호화 RNA의 발현을 보면 세포의 분화 및 분열, 그리고 세포의 종류에 따라서 특이적인 패턴을 확인할 수 있는데(6) 이는 곧 이러한 긴 비암호화 RNA들이 기능을 가지고 있음을 시사한다.

1.1 후성유전학적 조절인자로서의 기능

유전자(DNA)의 서열에 변화는 없지만 promoter methylation등 DNA 상의 화학적 modification을 통하거나 염색체를 구성하는 chromatin의 구조적 변화를 통하여 발현을 조절하는 현상을 후성유전학적 조절이라고 한다. Chromatin의 구조 조절과정에는 다양한 단백질들이 관여하는데 이들 chromatin remodeler들은 유전자 발현조절 뿐만 아니라 DNA 복제 및 손상복구 (Repair)에도 그 기능을 하는 것으로 알려져 있다(7). Chromatin remodeler는 복합체를 이루어 기능하는데 SWI/SNF, INO80/SWR1, ISWI, CHD family로 나누어 질 수 있다. 현재까지 50종 이상의 긴 비암호화 RNA가 이런 chromatin remodeler를 조절하는 것으로 알려져 있으며 (표1 참조)(8), 대표적으로는 lncBRM이 BRM과 결합하여 분화를 촉진하는 SWI/SNF 복합체를 저해하는 것으로 들 수 있다(9).

1.2 항암내성에 대한 긴 비암호화 RNA의 역할

항암 내성은 임상에서 암환자에 대한 치료전략이 어려움을 겪는 가장 큰 원인중 하나이며 암환자의 생존에 큰 위협이 되는 현상이다. 긴 비암호화 RNA는 암의 발생과정에도 여러가지 역할을 하지만 최근 연구들은 이러한 내성획득에도 조절기능을 가진다는 결과를 보여준다(10). 다양한 암종에서 현재까지 알려진 약 20여종의 내성관련 긴 비암호화 RNA는 표 2와 같다(10). 예를 들면 유방암 세포에서 CASC2 라는 긴 비암호화 RNA는 miR-18a-5p와 CDK19의 발현조절을 통해 Paclitaxel에 대한 내성을 증가시킨다(11). 또한 대장암 세포에서는 BANCR이라는 긴 비암호화 RNA가 miR-203의 sponge로 작용하여 CSE1L의 발현을 조절하고 이는 Adriamycin에 대한 세포사멸을 막음으로써 약물저항성을 나타내게 된다(12). 이 외에도 긴 비암호화 RNA는 약물의 배출을 돕거나 (FOXC2-AS1) EMT (Epithelial-Mesenchymal Transition)라는 세포변형과정으로 통해 항암내성을 증가시키기도 한다(13).

1.3 혈관형성 과정에서 긴 비암호화 RNA의 조절기능

암의 특징 중 하나인 지속적인 성장을 위해서는 영양분과 산소를 공급하는 것이 필수적이다. 이를 위하여 암은 비 정상적으로 혈관형성을 촉진하는 성질을 가지고 있는데 이는 또한 치료의 관점에서 암의 성장과 전이를 막는 중요한 약물타겟으로 활용되어 왔다. 긴 비암호화 RNA도 이러한 혈관형성과정에 관여하는 것으로 알려졌는데 (표3 참조)(14), 기존의 혈관형성 인자들을 조절하거나 microRNA와의 결합 혹은 암 미세환경의 변화를 통한 간접적인 조절기작도 알려지고 있다. 예를 들면 HIF2PUT은 대장암에서 HIF2a의 발현을 직접 유도하며(15), PVT1이라는 긴 비암호화 RNA는 위암에서 STAT3을 활성화하여 혈관형성유도 인자인 VEGF의 발현을 증가시킨다(16). 이외에도 간접적으로 VEGF의 발현을 증가시키는 OR3A4나 Wnt/beta-catenin 신호전달을 저해하여 혈관생성을 억제하는 GAS5등이 알려져 있다(14).

1.4 긴 비암호화 RNA의 유전자 발현 조절 기능 (ceRNA로서의 기능)

ceRNA (Competing Endogenous RNA)란 세포내의 한정된 miRNA및 RNA binding molecule들에 대하여 정상적인 mRNA와 경쟁함으로써 이들의 발현을 간접적으로 조절하는 RNA그룹을 칭한다(17). 일부 긴 비번역 RNA는 이런 ceRNA로 작용하는 것이 보고되었는데 예를 들면 CASC2는 miR-181a의 ceRNA로 작용하여 그 타겟인 RASSF6, PTEN, ATM의 발현을 증가시킨다(18). 비슷한 방법으로 NBAT1은 miR-21의 ceRNA로 작용하면서 PDCD4, RECK, TPM1등의 발현을 조절하게 된다(19). 이런 작용은 골육종이나 간암, 위암 등에서 나타나며 향후 더 많은 타겟들이 발굴될 것으로 생각된다(20).

2. 바이오마커로서의 긴 비암호화 RNA

비 암호화 RNA의 또다른 연구분야는 바이오마커로서의 응용이다. 암의 경우 바이오마커는 진단용과 예후 예측용으로 나누어 생각해 볼 수 있는데, 진단용은 영상자료나 다른 검사기법으로 조기진단이 어려운 암에 대하여 긴 비암호화 RNA를 마커로 사용하려는 시도이고 예후예측용은 암 진단 후 특정 치료전략에 대하여 잘 반응할 것인지 또는 어떤 종류의 치료제가 잘 작용할 것인지 정보를 제공하는 것으로 임상적인 중요성이 증가하고 있다.

2.1 혈중에 순환하는 (Circulating) 긴 비암호화 RNA

혈장에 존재하는 긴 비암호화 RNA는 혈액검사를 통하여 검출이 용이하다는 장점이 있다. 그 기능은 아직 많이 연구되지 못했지만 암세포에서 유래하여 다른 세포와의 소통에 관여하거나 혈관형성에도 영향을 줄수 있는데 예를 들면 유방암에서는 DSCAM-AS1이 보고된 바가 있고(21) 신장암에서는 lncRNA gradually increased during hepatocarcinogenesis (GIHCG) 라는 긴 비암호화 RNA가 진단용 마커로서 제시되었다(22). 또한 위암에서는 plasmacytoma variant translocation 1 (PVT1)나 gastric cancer associated transcript 2 (GACAT2)등이 혈장에 존재하는 마커로서 보고된 바 있다(23). 이러한 긴 비암호화 RNA는 기존에 연구되었던 microRNA와 함께 향후 혈액 기반의 진단마커로서 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

2.2 Exosome에 들어있는 긴 비암호화 RNA

Exosome (혹은 extracellular vesicle)은 세포가 능동적으로 배출하는 40-150nm정도의 소포(소낭)이며 세포간의 소통에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 암에서는 이 exosome을 통하여 암의 전이 및 혈관형성 그리고 암 미세환경에서의 면역회피 등이 이루어 진다고 생각되며 최근 연구들이 이를 뒷받침하는 결과들을 보여준다(24). Exosome안에는 단백질과 DNA 그리고 RNA등이 들어 있는데 이 중 긴 비암호화 RNA도 포함 있으며 대표적인 예로 lung cancer에서 발견되는 exosome유래의 긴 비암호화 RNA는 표 4와 같다(25). Exosome 안에 존재하는 RNA는 혈장에 있는 것 보다 더 안정적이고 다른 세포로의 전달성이 뛰어나므로 기능적으로도 더 유용한 바이오마커로 활용될 수 있다고 생각된다.

3. 긴 비암호화 RNA의 번역 현상

긴 비암호화 RNA는 정의상 번역이 되지 않고 유전자 상에 Open Reading Frame (ORF)가 없는 것으로 분류되었지만 최근 Ribosome profiling이라는 기술이나 단백체 분석 그리고 염기서열 분석법의 발달로 인해 일부 lncRNA가 펩타이드 혹은 단백질을 만든다는 사실이 알려지고 있다(26). 이 RNA들은 일반 mRNA와 같이 5’cap과 3’poly A signal을 가지고 있는데 시작암호인 AUG가 없이 비정상적인 번역이 이루어 진다. 예를 들면 HOXB-AS3에서 나오는 펩타이드의 경우는 hnRNPA1이라는 RNA접합 조절인자와 경쟁하여 PKM의 RNA편집을 조절하고 이는 암 대사의 변화를 초래한다(27). 또한 LOC90024라는 긴 비암호화 RNA는 SRSP라는 작은 단백질을 만드는데 이는 Sp4라는 전사인자 단백질의 생산에 영향을 주어 암을 유발하는 L-Sp4라는 아형을 만들도록 유도한다(28). 이 외에도 LINC00266-1는 RBRP라는 단백질을 만들고 LINC00998는 SMIM30를 생산하여 cMyc의 발현이나 MAPK의 활성도를 조절하고 있다(29). 이러한 분자적 현상들은 대장암과 간암, 유방암 등에서 발견되어 암을 촉진하는 새로운 기작으로 이해된다.

결론

지금까지 긴 비암호화 RNA의 다양한 기능과 바이오마커로서의 연구동향 그리고 최근 알려진 번역현상에 대하여 정리해 보았다. 이러한 긴 비암호화 RNA의 연구결과들에 대한 향후 응용방안을 살펴보자면 위에서 소개된 암을 유발하는 긴 비암호화 RNA들의 활성을 저해하기 위한 antisense oligonucleotide를 언급할 수 있다. 최근 연구에 의하면 위암모델에서 PVT1이라는 긴 비암호화 RNA의 antisense oligo (ASO)가 암 성장과 전이를 효과적으로 막는 것으로 보고되었고 뇌종양에서 NEAT1_1 ASO나 HNSCC (두경부 편평세포암)에서의 AC104014.1에 대한 ASO도 암 억제 기능이 기능이 밝혀졌다. 긴 비암호화 RNA는 많은 경우 핵에 위치하는데, 이를 효과적으로 제거하기 위해서 핵에 위치하는 RNaseH를 활성화시키는 Gapmer라는 신개념 ASO도 활발히 연구되고 있다(30). 이와 관련하여 임상시험중인 신약들의 등록 사이트인 clinicaltrials.gov를 검색해 보면 현재 17건의 암 관련 긴 비번역 RNA에 대한 임상연구가 이루어지고 있는데 이중 상당부분은 바이오마커로서 특정 긴 비번역 RNA를 시험하는 것으로 향후 연구결과에 따라 다양한 암종에서의 적용이 기대 된다.

 

 

 

1. 긴 비번역 RNA들의 후성유전학적 조절기능(8)

lncRNA (name UCSC)

Binding to

Type of lncRNA

Action

SWI/SNF subunits (Histone dimer/nucleosome removal, nucleosome sliding)

Evf2 (DLX6-AS1)

SMARCA4

Antisense of DLX6

Competing with transcription factor DLX1 for binding to BRG1

UCA1

SMARCA4

Intergenic

Prevents binding to p21 promoter UCA1 expression regulated by ARID1A

TUG1

SMARCA4

Intergenic, sharing promoter with MORC2

Inhibiting BRG1 degradation

Myheart (Mhrt)

SMARCA4

Antisense of MYH7

Binding to BRG1 prevents DNA binding of SWI/SNF complex

CPS1IT1

SMARCA4

Intronic of CPS1 gene

Prevents binding to Cyr61 promoter region

NEAT1

SMARCA2, SMARCA4

Intergenic

Facilitates the organization of paraspeckle proteins (independent of SMARCA catalytic activity)

MALAT1

SMARCA4

intergenic

Complex with HDAC9 that represses vascular smooth muscle cell genes

LincRNA Cox2

SMARCA4

Antisense

Recruiting the SWI/SNF complex to inflammatory-response genes, e.g., Saa3 and Ccl5

IL-7AS

p300/SMARCA4

Antisense

Recruiting HAT p300 followed by recruitment of SWI/SNF complex to activate inflammatory genes, (e.g., CCL2, CCL5, and IL-6)

LncFZD6 (BAALC-AS1)

SMARCA4

Antisense, sharing promoter with FZD6

Recruits SWI/SNF complex to FZD6 promoter,

lncTCF7

SMARCA4

antisense

Recruiting the SWI/SNF complex to the TCF7 promoter

lncBRM

SMARCA2

Antisense

Associates with BRM and favors assembly of BRG1- BAF complexes in liver cancer stem cells

SWINGN (LINC00565/LINC00452)

SMARCB1

Intergenic, sharing promoter with GAS6

Transcriptional activation of several genes (e.g., GAS6, PDGFRB and COL1A1).

HOTAIR

SMARCB1, ARID1A

Intergenic, sharing promoter of HOXC11

Affecting expression of transcriptional repressor gene SNAIL

MVIH (AK094613)

ARID1A

Intragenic, overlapping RPS24 exons

Affects CDKN1A transcription

DGCR5

ARID1A

Intergenic

Promotes p21 expression

LINC00163

ARID1A

Intergenic

Stimulation of TCF21 expression

uc.291*

ACTL6A

Intragenic at LRMDA gene

Prevents inhibition by ACTL6A on epidermal differentiation genes

CDKN2B-AS1

BCL11A

Antisense

Inhibition of MAP4K1

uc.57*

BCL11A

Intergenic upstream of BCL11A

Inhibition of PI3K/AKT and MAPK signaling pathways

Xist

SWI/SNF

Intergenic

Binding to SWI/SNF complex inhibits binding to Xi-genes regions

MANTIS

DNA

Intragenic, ANXA4 gene

Preventing SWI/SNF complex binding at ICAM-1 promoter region

SChLAP1

DNA

intergenic

SMARCA4 associates frequently with primary transcripts including SChLAP1, preventing SWI/SNF complex binding

CASC15

miR-221

Intergenic

ceRNA ARID1A

DLEU1

miR-490-3p

Intergenic sharing promoter of DLEU2

ceRNA CDK1, CCND1 and SMARCD1

INO80/SWR1 subunits (nucleosome replacement)

LCTS5 (AC008610.1)

INO80

Intergenic

Binding to INO80 inhibits binding to enhancer regions near lung cancer associated genes.

HAND2AS1 (lncHand2)

INO80

Antisense, sharing promoter with SCRG1

Recruiting the INO80 complex to e.g. the BMP-R1A and Nkx1-2 promoter

ANRIL

YY1

Antisense in INK4 Locus

Recruitment of YY1 to promoter loci of IL6 and IL8

Linc-YY1

YY1

Intragenic of YY

evict YY1/Polycomb repressive complex (PRC2) from target promoters

lncAKHE (AK056594)

YEATS4

Intragenic of TRIM55

activation of NOTCH2 signaling in hepatocellular carcinoma

DRAIC

UCHL5

Intergenic

Promotes NFRKB (INO80G) ubiquitination-mediated degradation

CASC7

miR-21

Intergenic (in between CHRAC1-Ago2)

ceRNA ING3

RNCR3 (LINC00599)

miR-185-5p

Intergenic

ceRNA BRD8

TUG1

miR-145 and YY1

Intergenic, sharing promoter with MORC2

Interference PRC2 complex

CR933609

miRNA-5096

Overlapping INO80D 3UTR

ceRNA INO80D

SPAG5-AS1

miR-769-5p

Antisense

ceRNA YY1

HOTAIR

miR-1, miR-206

Intergenic, sharing promoter of HOXC11

ceRNA YY1

LINC00899

miR-744-3p

Intergenic

ceRNA YY1

LINC00668

miR-532-5p

Intergenic

ceRNA YY1

Linc01134

miR-324-5p

Intergenic

ceRNA IGF2BP1, increased stability YY1 expression

LncKdm2b (KDM2B-DT)

SRCAP

Antisense to Kdm2b

SRCAP complex recruitment to Zbtb3 gene, activating expression of this transcription factor

ISWI (nucleosome spacing, DNA repair)

LncKdm2b (KDM2B-DT)

SATB1-ISWI

Antisense to Kdm2b

NURF complex directed to Zfp292 promoter via recruitment of chromatin organizer SATB1 (also capable of recruiting SWI/SNF complexes)

NMR (LINC01672)

BPTF

Intergenic

NURF complex recruitment promoting ERK1/2 signaling pathway

DLEU1

SMARCA1

Intergenic sharing promoter of DLEU2

NURF complex recruitment activating of KPNA3

NEXN-AS1

BAZ1A

Antisense

Upregulation of NEXN expression, which is associated with atherosclerosis-related diseases

Lnc pRNA

BAZ2A

At intergenic spacer (IGS) sequences separating rDNA regions

Establishment of heterochromatin at ribosomal RNA genes (repression) e.g. RNA45SN2 (45S pre-rRNA)

Paupar

TRIM28

Intragenic of PAX6-AS1

promotes KAP1 (H3K9me3 deposition) recruitment at a subset of distal targets, through formation Paupar-KAP1-PAX6 complex

BlackMamba ()

HELLS

Intergenic upstream of KCNMA1

Gene expression (e.g., RGS1, CCL17, CCL22, PAK2, and KCNMA1) in anaplastic large cell lymphoma

FGD5-AS1

miR-302e

Antisense

ceRNA CDCA7

CHD (chromodomain helicase DNA-binding, DNA repair; NuRD, histone deacetylation/demethylase complex)

CHASERR (LINC01578)

CHD2

Intergenic, upstream of CHD2

Transcriptional interference between Chaserr and CHD2 results in negative feedback loop

MATN1-AS1

miR-200b/c/429

Antisense

ceRNA CHD1

LINC01410

miR-23c

Intergenic

ceRNA CHD7

ANRIL

miR-34a

Antisense in INK4 Locus

ceRNA HDAC1

SNHG15

miR-490-3p

miRNA host gene

ceRNA HDAC2

ARAP1-AS1

miR-2110

antisense

ceRNA HDAC2

HOTAIR

miR-326

Intergenic, sharing promoter of HOXC11

ceRNA MTA2

 

2 약물저항성에 대한 긴 비암호화 RNA의 기능들(10)

LncRNA

Tumor

Drug

Promote/inhibit resistance

Mechanism of action

HOXA-AS3

NSCLC

DDP

EMT

MALAT1

lung adenocarcinoma

DDP

Drug efflux system

TUG1

SCLC

VP-16 &DDP

Apoptosis

LINC00665

NSCLC

Gefitinib

PI3K/Akt signaling

LINC01116

NSCLC

Gefitinib

(IFN)/STAT1 signaling

MEG3

NSCLC

DDP

miR-21-5p/SOX7 axis

FOXF1

NSCLC

DDP

Drug efflux system

LINC00968

breast cancer

Adriamycin, Taxel and vincristine

Wnt2/β-catenin signaling

SNHG14

breast cancer

Trastuzumab

PABPC1/ H3K27 acetylation

TINCR

breast cancer

Trastuzumab

EMT

DSCAM-AS1

breast cancer

Tamoxifen

Cell cycle

H19

breast cancer

Tamoxifen

Autophage

NR2F1-AS1

HCC

OXA

Drug efflux system

KRAL

HCC

5-FU

Keap1/Nrf2 signaling

FOXD2-AS1

HCC

Sorafenib

MiR-150-5p/TMEM9 signaling

SNHG1

HCC

Sorafenib

Akt signaling

LncARSR

HCC

Adriamycin

PI3K/Akt signaling

CRNDE

HCC

Adriamycin

Apoptosis

MEG3

CML

Imatinib

Apoptosis and drug efflux system

GAS5

EOC

DDP

MAPK signaling

“↑” indicates resistance promotion, and “↓” indicates resistance inhibition.

 

 

3. 혈관형성에 관여하는 긴 비암호화 RNA(14)

LncRNA

Impact on Angiogenesis

Regulatory Mechanism

1. Hepatic Cancer

 

 

BZRAP1-AS1

Activating pathways or protein binding

MVIH

OR3A4

PTENP1

UBE2CP3

CRNDE

Interacting with transcripts

HULC

LEF1-AS1

LINC00488

MALAT-1

OIP5-AS1

TUG1

cox-2

Affecting neighboring tumor cells

H19

2. Gastrointestinal Cancer

 

 

AK001058

Activating pathways or protein binding

FLANC

GAS5

HNF1A-AS1

LINC00858

LINC01314

MALAT-1 1

MVIH

NBAT1

OR3A4

PVT1

SUMO1P3

TPT1-AS1

LINC01410

Interacting with transcripts

lncRNA-HNF1A-AS1

ZFAS1

lncRNA-APC1

Affecting neighboring tumor cells

CASC2

unknown

OR3A4

3. Brain Tumor

 

 

HULC

Activating pathways or protein binding

PAXIP1-AS1

 

PDIA3P1

 

SLC26A4-AS1

H19

Interacting with transcripts

LINC01116

MCM3AP-AS1

SBF2-AS1

SNHG15

TUG1

XIST

 

AHIF

Affecting neighboring tumor cells

CCAT2

HOTAIR

POU3F3

4. Reproductive System Cancer

 

CASC2

Activating pathways or protein binding

LINC00284

PVT1

TUG1 1

DANCR

Interacting with transcripts

MEG3

PCAT3

PCAT9

RBMS3-AS3

SCAMP1

CCDST

Affecting neighboring tumor cells

MALAT-1

5. Lung Cancer

 

 

LINC00665

Activating pathways or protein binding

LINC00667

lincRNA-p21

LOC100132354

MEG3

MVIH

TNK2-AS1

F63

Interacting with transcripts

FBXL19-AS1

GAS5 1

MCM3AP-AS1

PVT1

HOXA11-AS

unknown

6. Breast Cancer

 

 

EFNA3

Activating pathways or protein binding

HIF-1A-AS2

LINC00908

MALAT-1

MEG3

NKILA

 

RAB11B-AS1

 

LINC00968

Interacting with transcripts

lncRNA-Hh

Affecting neighboring tumor cells

7. Other Cancer Types

 

 

HOTAIR

Activating pathways or protein binding

MALAT-1 1

PANTR1

DANCR

Interacting with transcripts

LINC00511

SNHG6

 

RP11-79H23.3

 

TUG1

RAMP2-AS1

Affecting neighboring tumor cells

H19

 

4. 폐암에서 발견되는 Exosomal 긴 비암호화 RNA(25)

LncRNAs

Exosome function

Origin of exosomes

Sample collection

Recipient cells

H19

Promotes gefitinib/erlotinib resistance

HCC827, HCC4006, A549

Blood, culture medium

Non-small cell lung cancer

GAS5

Biomarker

NSCLC cells

Blood

/

GAS5

Promotes tumor angiogenesis

Lung cancer cells

Culture medium

Human umbilical vein endothelial cells

MALAT 1

Promotes cell proliferation and migration

NSCLC cells

Blood

A549, H1299

RP11-838N2.4

Promotes erlotinib resistance

NSCLC cells

Blood

HCC827, HCC4006

DLX6-AS1

Biomarker

NSCLC cells

Blood

/

/

Regulate silicosis

Lung tissue of silica-exposed rats

/

/

RP11-397D12.4, AC007403.1, and ERICH1-AS1

Biomarker

NSCLC cells

Blood

/

SOX2-OT

Biomarker

LUSC cells

Blood

/

/

Changes microenvironment

A549 cells

Culture media

Mesenchymal stem cells

HOTAIR

Promotes cell proliferation, migration, and invasion

Lung cancer cells

Blood

A549 and H1299

MSTRG.292666.16

Promotes osimertinib resistance

NSCLC cells, H1975 cells

Blood

H1975 cells

MRPL23-AS1

Creates a premetastatic microenvironment

SACC cells

Culture medium

HPMECs

UCA1

Promotes gefitinib resistance

NSCLC cells, HCC827, PC9

Blood, culture media

HCC827, PC9

UFC1

Promotes cell proliferation, migration, and invasion

NSCLC cells

Blood, culture media

A549, H1299

/ represent not explicit or mentioned; NSCLC, non-small cell lung cancer; LUSC, lung squamous cell carcinoma; SACC, salivary adenoid cystic carcinoma; HCC827/HCC4006/H1975/A549/H1299/PC9, lung cancer cell lines; HPMECs, human pulmonary microvascular endothelial cells.

 

 

 

 

참고문헌

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2. Plath K, Mlynarczyk-Evans S, Nusinow DA and Panning B (2002) Xist RNA and the mechanism of X chromosome inactivation. Annu Rev Genet 36, 233-278
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